As Geociências constituem importante aspecto em diversos projetos de pesquisa em Unidades de Conservação, fornecendo bases do conhecimento do meio físico para subsidiar seus planos de gestão ambiental, principalmente nas áreas de geologia, geomorfologia e climatologia.
Os diagnósticos técnicos do meio físico das Unidades de Conservação, realizados nos últimos anos, partiram de diferentes demandas de setores da SMA, tais como: Áreas de Proteção Ambiental de Corumbataí, Botucatu e Tejupá, Parque Estadual Intervales, Parque Estadual Turístico do Alto Ribeira - PETAR e Unidades de Conservação abrangidas pelo PPMA - Projeto de Preservação da Mata Atlântica, tais como Parque Estadual da Serra do Mar (Núcleos Cubatão, Caraguatatuba, São Sebastião, Picinguaba e Santa Virgínia), Parque Estadual de Ilhabela, Parque Estadual da Ilha do Cardoso, Parque Estadual de Campina do Encantado, Estação Ecológica dos Chauás e Estação Ecológica de Bananal (ver em Projetos).